Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5640A3KG49 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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