Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms