Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf39A2RT81 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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