Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Frmpd1A2AKB4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms