Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms