Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myom3A2ABU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myom3A2ABU4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms