Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms