Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav12-2A0N8N6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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