Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms