Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gria3Q9Z2W9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms