Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms