Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms