Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms