Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp2Q9Z0E6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp2Q9Z0E6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms