Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms