Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabbr1Q9WV18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabbr1Q9WV18 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms