Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nrf1Q9WU00 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nrf1Q9WU00 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nrf1Q9WU00 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms