Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv2Q9WTR1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms