Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorbs3Q9R1Z8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms