Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ntn3Q9R1A3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntn3Q9R1A3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms