Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt71Q9R0H5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt71Q9R0H5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms