Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms