Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ67

Ppm1d, Protein phosphatase 1D, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1dQ9QZ67 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ppm1dQ9QZ67 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppm1dQ9QZ67 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms