Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms