Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf354bQ9QXT9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf354bQ9QXT9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf354bQ9QXT9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf354bQ9QXT9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf354bQ9QXT9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms