Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim44Q9QXA7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms