Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Homer2Q9QWW1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms