Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rai2Q9QVY8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms