Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cln8Q9QUK3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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