Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoaQ9QUI0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms