Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp1Q9JLK7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms