Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gde1Q9JL56 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms