Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem1Q9JKE2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms