Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms