Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mlh1Q9JK91 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms