Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smpd3Q9JJY3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smpd3Q9JJY3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms