Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms