Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1fQ9JIS7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms