Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms