Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mkrn2Q9ERV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn2Q9ERV1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms