Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tor1bQ9ER41 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms