Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms