Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms