Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms