Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmco5aQ9D9D5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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