Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PudpQ9D5U5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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