Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1e2Q9D593 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1e2Q9D593 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms