Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc7Q9D541 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms