Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrameQ9D4Z5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms