Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhd1Q9D4J1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms